28 июля 2021, среда, 15:52
VK.comFacebookTwitterTelegramInstagramYouTubeЯндекс.ДзенОдноклассники

НОВОСТИ

СТАТЬИ

PRO SCIENCE

МЕДЛЕННОЕ ЧТЕНИЕ

ЛЕКЦИИ

АВТОРЫ

20 апреля 2016, 08:00

Настоящее и будущее геномных исследований

Владимир Брюхин, Стивен О’Брайен, Татьяна Татаринова, Юрий Никольский
Владимир Брюхин, Стивен О’Брайен, Татьяна Татаринова, Юрий Никольский
Фото: Sk.ru

Более двухсот слушателей собрались на открытой конференции по популяционной и медицинской генетике человека «Геном России», которая состоялась в Гиперкубе Инновационного центра «Сколково» 14 апреля. Среди докладчиков – ведущие российские и зарубежные специалисты в области популяционной генетики человека, лидеры международных и национальных геномных проектов.

Широкомасштабные проекты по секвенированию геномов населения разных стран направлены, в первую очередь, на поиски генов болезней, стратификацию клинических испытаний, а также реконструкцию истории государств и народов. Подобные исследования ведутся в США, Великобритании, Китае, Катаре, Саудовской Аравии и Скандинавских странах. Несмотря на то, что в России геногеография, изучение распределения различных генов, существует более ста лет, национальные программы по полногеномному секвенированию только зарождаются.

Во многом конференция состоялась благодаря научным связям «Сколково» с Университетом Южной Каролины в Лос-Анджелесе. Об идее собрать видных ученых, работающих с геномами, для обмена опытом, обсуждения  современного уровня геномных исследований, а также перспектив и путей развития популяционной̆ генетики в России рассказывает сопредседатель конференции Юрий Никольский, Директор по науке кластера биомедицинских технологий Фонда «Сколково»:

«С Университетом Южной Калифорнии «Сколково» взаимодействует очень давно через известного профессора, анестезиолога Владимира Зельмана. Два года назад делегация «Сколково» посетила Университет и знаменитый Children’s Hospital в г. Лос-Анджелес, с тех пор началась наша дружба. В частности, профессор Татьяна Татаринова (сопредседатель конференции – прим. ред.) стала часто бывать в России, где у нее появилось много коллабораций; она стала экспертом «Сколково» и основателем одного из стартапов. В конце 2015 г. мы решили провести конференцию, посвященную национальным программам генотипирования и секвенирования населения, в первую очередь в России».

Юрий Никольский. Фото: Sk.ru

Обсуждаемые на конференции исследования были разделены на три тематических блока: мировые геномные инициативы; палеогенетика, история, лингвистика; клинические применения генетических данных.

Мировые геномные инициативы

Первые три доклада были посвящены запущенному год назад и поддержанному президентом проекту «Российские геномы». Проект реализуется на базе двух лабораторий Санкт-Петербургского государственного университета: Центра геномной биоинформатики им. Ф.Г. Добржанского, созданного 5 лет назад в ходе реализации государственной программы мегагрантов, и Центра алгоритмической биотехнологии под руководством Павла Певзнера, образованной в рамках собственной программы мегагрантов СПбГУ. Также в работе проекта задействованы коллеги из различных регионов России и Вычислительный центр СПбГУ.

Cергей Павлович Туник, проректор по научной работе СПбГУ, рассказал об организационных аспектах работы над «Российскими геномами», упомянув, что представление проекта в 2015 году «вызвало споры», но само его «проведение было признано целесообразным». По его словам, к настоящему времени выстроена организационная структура проекта, создана необходимая экспериментальная база, проведено 2 экспедиции, в этом году планируется еще 9. Одним из насущных правовых вопросов является разработка правил работы с персональными данными доноров. «Мы рассматриваем этот проект как один из наиболее приоритетных для Санкт-Петербургского университета в ближайшее время», – подчеркнул Сергей Туник.

Рассказывая о практической стороне проекта Владимир Брюхин из Центра геномной биоинформатики им. Ф.Г. Добржанского остановился на целях и подходах. Миссия проекта ­­– сбор генетических данных в Российской Федерации в медико-генетическом и историческом ракурсе: для идентификации частот рекомбинации гаплотипов, характерных для определенных этнических и географических популяций, собираются образцы крови из семейных триад (биологических родителей и их детей). Запланированный объем выборки – 2500 человек.

Стивен О'Брайен, американский генетик, координирующий  работу проекта «Российские геномы» в Центре геномной биоинформатики им. Ф.Г. Добржанского, уточнил, что одной из задач проводимых исследований является проверка гипотезы о миграция человека в последние несколько десятки тысяч лет. В то же время он считает, что сбор клинических данных в рамках проекта – дело будущего. На данный момент в рамках проекта при помощи антропологов собраны генетические данные  923 человек, представляющих этнические группы башкир, татар, чеченцев, калмыков, карачаевцев и балкарцев.

Халид Фархо. Фото: Sk.ru

Халид Фархо (Sidra Medical and Research Center) сосредоточился в своем выступлении на популяционной и клинической геномике в Катаре. Катар – первая страна, которая три года назад объявила, что собирается просеквенировать абсолютно всех своих жителей. Оказывается, население страны очень разнородно и в его генетическом разнообразии прослеживается предковый генофонд для европейских популяций.

Об одной из лучших программ мира по генотипированию населения в Японии на базе RIKEN – японского Института физико-химических исследований, рассказал Олег Гусев (Казанский федеральный университет). Работы по генотипированию позволили установить врожденный риск к раку, продемонстрировав практическое применение фундаментальных исследований.  В КФУ совместно с RIKEN была создана генетическая лаборатория, которую возглавил Олег Гусев. Кроме того недавно его компания стала резидентом «Сколково», что должно помочь продолжить генетические исследования на территории Татарстана.

Палеогенетика, история, лингвистика

Блок докладов «Палеогенетика, История, Лингвистика» объединил выступления ученых, посвященным фундаментальным исследованиям мирового генетического разнообразия.

Татьяна Григорьева (КФУ) рассказала о составлении генетического атласа республики Татарстан в тесном сотрудничестве медиков, генетиков, историков, биологов, антропологов и других специалистов. Егор Прохорчук (Центр «Биоинженерия» РАН) поделился трудностями анализа генетических данных современных этнических групп России и опытом работы с палеоматериалами.

Дискуссию вызвал доклад Эрана Элхаика (The University of Sheffield) под названием «Недостающее звено в происхождении евреев Европы», в котором данные генетики использовались для выяснения истоков языка идиш и генофонда евреев ашкенази. Математик и сопредседатель конференции Татьяна Татаринова (USC, CHLA) представила программу reAdmix, позволяющую моделировать индивидуальный генотип как смесь генотипов. Ее применение на жителях Сибири – кетах, позволило установить их близость к  палео-эскимосам. 

Татьяна Татаринова. Фото: Sk.ru

Эльза Хуснутдинова (Институт биохимии и генетики УНЦ РАН) представила основательное исследование структуры генофонда и генетической истории современных народов Волго-Уральского региона, Средней Азии, Сибири и Северного Кавказа. В частности, было показано южносибирское происхождения единого генетического пласта у всех тюркоязычных групп. В свою очередь, Олег Балановский (Институт Общей генетики РАН) сделал ретроспективный и перспективный обзор исследований генофонда народов России.

Клинические применения генетических данных

Применению генетических данных в медицине был посвящен завершающий блок докладов. Так, Светлана Боринская (Институт Общей генетики РАН) продемонстрировала, как изучение генетических данных открывает путь к разработке и репозицинонированию лекарств.

Важнейшими открытиями новых генов и мутаций у якутов, представляющих собой «генетический изолят», поделилась Надежда Максимова (Северо-Восточный Федеральный университет). В результате молекулярно-генетических исследований были открыты гены редкого наследственного заболевания – SOPH–синдрома, при котором у младенцев происходит поражение зрительных нервов и развивается иммунодефицит, а также были выявлены мутации в генах редких заболеваний.

Светлана Лимборская из Института молекулярной генетики РАН обратила внимание собравшихся на выявленную этногенетическую разницу в реакции онкологических больных на химотерапию. В своем выступлении Светлана Горохова (Научно-клинический центр ОАО «РЖД») проанализировала генотипирование как метод определения риска сердечно-сосудистых заболеваний среди машинистов РЖД и целесообразность скрининга основных заболеваний этой группы на основе клинико-экономического анализа.

Два доклада сделали представители Ibinom – сильной биоинформатической группы, которая занимается анализом данных SNP и NGS секвенирования. Компания стала резидентом «Сколково» и недавно получила грант фонда на дальнейшее развитие облачного сервиса по медицинской интерпретации генетических данных. Дарья Яковишина продемонстрировала, что для детекции вариаций числа копий генов, обуславливающих определенные заболевания, предпочтительней полногеномные данные секвенирования.  Илья Корвиго рассказал о применении нейронных сетей для оценки патогенности мутаций.

Свои разработки презентовали участникам конференции спонсоры Thermo Fisher Scientific, ведущий производитель оборудования для клинической лабораторной диагностики, и Альбиоген, сервисная компании продукции Illumina. Также в рамках конференции состоялось рабочее совещание по вопросам реализации проекта «Российские геномы».

В заключение Юрий Никольский поделился планами на будущее: «Это была первая научная конференция в «Сколково» по геному человека, думаю, мы будем продолжать  проведение подобных конференций. Если говорить про кластер, сейчас очень быстро развивается сельско-хозяйственное направление: недавно была вызвавшая огромный интерес конференция по точечному земледелию. До конца года пройдут еще три конкурса по сельскому хозяйству: по генетике и селекции, по точечному земледелию и по переработке сырья».

Организаторы рассчитывают, что конференция создаст новые научные связи, а также способствует появлению новых проектов для «Сколково» и Сколтеха.

Обсудите в соцсетях

Главные новости

29.05 17:58 Миронов вручил Стивену Сигалу партбилет «Справедливой России — За правду»
29.05 17:14 МИД объявил, что россиянам не придется возвращаться из-за границы ради нового загранпаспорта
29.05 16:51 Lufthansa получила от России разрешение на полеты в обход Белоруссии
29.05 16:15 В Москве открыли новый железнодорожный вокзал — впервые за сто лет
29.05 15:52 В Черном море у Туапсе появилось новое нефтяное пятно длиной 150 метров
29.05 14:25 Air France согласовала с Россией план полетов в обход Белоруссии
29.05 13:46 Прокуратура попросила лишить свободы на пять лет чеченца, вступившего в драку с росгвардейцами на акции протеста
29.05 12:58 Количество автокредитов в России достигло исторического максимума в апреле
29.05 12:16 Глава «Белавиа» назвал западные санкции «подлостью» и «наказанием невиновных»
29.05 11:53 Адвокат Мария Эйсмонт выиграла суд у полицейских, не пустивших ее к задержанным под предлогом плана «Крепость»
29.05 11:25 В России третий день подряд фиксируют больше 9 тыс. заболевших ковидом
29.05 11:00 Президент Финляндии назвал действия Минска «революционным вмешательством в международную практику»
29.05 10:17 Forbes: российские авиакомпании начали облетать Белоруссию
29.05 09:44 Во Вьетнаме нашли новый штамм коронавируса — еще более заразный гибрид британского и индийского штаммов
29.05 09:13 США приостановят соглашение с Белоруссией об авиасообщении и введут новые санкции против Минска
28.05 22:19 ФСБ и СК задержали саратовских подростков и обвинили их в экстремизме и участии в украинской радикальной группировке
28.05 21:48 Euronews: нигерийские власти подтвердили гибель 76 человек, плывших в лодке, перевернувшейся в штате Кебби
28.05 21:10 Haberturk: из-за аварии танкера Rava приостановлено движение судов через Босфор
28.05 21:00 Минздрав опроверг невозможность исследования комбинации AstraZeneca и «Спутник V»
28.05 20:47 Против редактора DOXA Владимира Метелкина завели еще одно уголовное дело. Его обвиняют в клевете на следователя
28.05 20:19 CTV: в Канаде на территории бывшей школы-пансионата для коренных народов нашли захороненные останки 215 детей
28.05 19:52 Наталья Поклонская снялась с праймериз «Единой России» «в связи с новой работой» и сообщила, что снова сможет надеть китель
28.05 19:23 МИД РФ: вся ответственность за развал Договора по открытому небу лежит на США
28.05 19:05 Лукашенко заявил Путину, что в Белоруссии «идет попытка раскачать ситуацию до уровня августа прошлого года»
28.05 18:14 Ярославским курсантам училища ПВО приказывают голосовать на праймериз «Единой России»
28.05 17:59 «Фармвестник»: Минздрав РФ отказался от испытаний комбинации вакцин AstraZeneca и «Спутник V»
28.05 17:28 Участника Pussy Riot Тима Бесцвета арестовали из-за акции с радужными флагами в Москве
28.05 17:09 К россиянке Софье Сапеге пустили адвоката спустя пять дней после задержания в Минске
28.05 16:54 ТАСС: Малайзия вводит полный локдаун на две недели
28.05 16:37 В Ульяновске начались одиночные пикеты против принудительной вакцинации от коронавируса, фактически объявленной указом губернатора
28.05 16:31 Литва выслала двух белорусских дипломатов
28.05 16:08 Люблинский суд смягчил ограничения для фигуранта «Нового величия» Дмитрия Полетаева. Он сможет передвигаться по всей Москве
28.05 15:58 WSJ: Год назад Nike разорвала контракт с Неймаром из-за обвинений в домогательствах в его адрес
28.05 15:35 В Сочи арестовали аниматоров в костюмах коней. Они вымогали деньги у прохожих
28.05 15:32 В свердловском селе дети записали для мэра рэп о том, что очень «хотят надрать зад» тем, из-за кого у них нет воды
28.05 15:04 Подозреваемых в планировании терактов на Ставрополье арестовали на два месяца
28.05 14:52 Жителя Нарьян-Мара оштрафовали за посты в соцсети с подписью, что Крым принадлежит Украине
28.05 14:36 Документы Стивена Хокинга оцифруют и поместят в библиотеку Кембриджского университета
28.05 14:34 Станислав Козловский: «Википедия» может быть признана иноагентом по «закону о приземлении», если откроет свой филиал в России
28.05 14:33 Суд в Минске отклонил жалобу на задержание россиянки Софьи Сапеги
28.05 14:00 Палеонтологи изучили яйца вымершего подвида эму
28.05 14:00 РФ разрешила Austrian Airlines выполнить рейс в Москву в облет Белоруссии. Разрешения на другие рейсы авиакомпании пока нет
28.05 13:55 Мосгорсуд огласил приговор бывшим полицейским по делу Голунова. Они получили от 5 до 12 лет колонии
28.05 13:26 Полиция подозревает оренбургского первоклассника в участии в несанкционированном митинге. Он держал плакат с просьбой отремонтировать школу
28.05 13:04 ФБР решило помочь в расследовании инцидента с самолетом авиакомпании Ryanair
28.05 12:51 Гендиректор Ryanair назвал захват самолета с Романом Протасевичем «незаконным и предосудительным действием»
28.05 12:41 Генпрокурор Краснов за прошлый год увеличил доход в три раза и обогнал Бастрыкина
28.05 12:11 В правительстве предложили запретить ватные палочки и пластиковую посуду
28.05 12:00 Затопленная итальянская деревня спустя 70 лет вновь оказалась на поверхности
28.05 11:59 Профессору Митько, обвиняемому в госизмене, не разрешили выступить на Международном арктическом саммите
«АвтоВАЗ» «ВКонтакте» «Газпром» «Зенит» «Мемориал» «Мистраль» «Оборонсервис» «Роснефть» «Спартак» «Яблоко» Абхазия Австралия Австрия Азербайджан Антимайдан Аргентина Арктика Армения Афганистан Аэрофлот Башкирия Белоруссия Бельгия Болгария Бразилия Бурятия ВВП ВКС ВМФ ВПК ВТБ ВЦИОМ Ватикан Великобритания Венгрия Венесуэла Владивосток Внуково Волгоград ГИБДД ГЛОНАСС Генпрокуратура Германия Голливуд Госдеп Госдума Греция Гринпис Грузия ДТП Дагестан Дания Домодедово Донецк ЕГЭ ЕСПЧ Евровидение Еврокомиссия Евромайдан Евросоюз Египет Екатеринбург ЖКХ Израиль Ингушетия Индия Индонезия Интерпол Ирак Иран Испания Италия Йемен КНДР КПРФ Казань Казахстан Калининград Камчатка Канада Каталония Кемерово Киев Кипр Киргизия Китай Коми Конституция Красноярск Кремль Крым Куба Курилы ЛГБТ ЛДПР Латвия Ливия Литва Лондон Луганск МВД МВФ МГУ МКС МОК МЧС Малайзия Мексика Минздрав Минкульт Минобороны Минобрнауки Минпромторг Минсельхоз Минск Минтранспорта Минтруд Минфин Минцифры Минэкономразвития Минэнерго Минюст Молдавия Мосгордума Мосгорсуд Москва НАСА Нигерия Нидерланды Новосибирск Норвегия ОАЭ ОБСЕ ООН ОПЕК Одесса Омск ПДД Пакистан Паралимпиада Париж Пентагон Польша Приморье РАН РЖД РПЦ РФС Росавиация Росгвардия Роскомнадзор Роскосмос Роспотребнадзор Россельхознадзор Россия Росстат Ростех Ростуризм СМИ СССР США Сахалин Сбербанк Севастополь Сербия Сирия Сколково Славянск Сочи Таджикистан Таиланд Татарстан Трансаэро Турция УЕФА Узбекистан Украина ФАС ФБР ФИФА ФСБ ФСИН ФСКН Филиппины Финляндия Франция Хакасия Харьков ЦИК ЦРУ ЦСКА Центробанк Чехия Чечня Швейцария Швеция Шереметьево Эбола Эстония ЮКОС Якутия Яндекс Япония авиакатастрофа автопром алкоголь амнистия арест армия археология астрономия аукционы бактерии банкротство беженцы безработица бензин беспилотник беспорядки биатлон бизнес благотворительность блогосфера бокс болельщики вандализм взрыв взятка вирусы вузы выборы гаджеты генетика гомосексуализм госбюджет госзакупки госизмена демография деньги дети доллар допинг драка евро журналисты законотворчество здоровье землетрясение изнасилование импорт инвестиции инновации интернет инфляция ипотека искусство ислам исследования история казнь кино кораблекрушение коронавирус коррупция космос кража кредиты культура лингвистика литература математика медиа медицина метро мигранты монархия мошенничество музыка наводнение налоги нанотехнологии наркотики наука недвижимость нейробиология некролог нефть образование обрушение общество ограбление оппозиция опросы оружие офшор палеонтология педофилия пенсия пиратство планетология погранвойска пожар полиция похищение правительство право православие преступность продовольствие происшествия психология пытки ракета рейтинги реклама религия ретейл робототехника рубль санкции связь сепаратизм следствие смартфоны смертность социология спецслужбы спутники статистика страхование стрельба строительство суды суицид тарифы театр телевидение теракт терроризм технологии транспорт туризм убийство фармакология физика фоторепортаж футбол хакеры химия хоккей хулиганство цензура школа шпионаж экология экономика экспорт экстремизм этология «Единая Россия» «Исламское государство» «Нафтогаз Украины» «Правый сектор» «Северный поток» «Справедливая Россия» «болотное дело» Александр Бастрыкин Александр Лукашенко Александр Новак Александр Турчинов Алексей Кудрин Алексей Навальный Алексей Улюкаев Алтайский край Амурская область Анатолий Сердюков Ангела Меркель Антон Силуанов Аркадий Дворкович Арсений Яценюк Астраханская область Барак Обама Басманный суд Башар Асад Белый дом Борис Немцов Бутовский полигон Валентина Матвиенко Верховная Рада Верховный суд Виктор Янукович Виталий Милонов Виталий Мутко Владимир Жириновский Владимир Зеленский Владимир Маркин Владимир Мединский Владимир Путин Вячеслав Володин Дальний Восток День Победы Дмитрий Медведев Дмитрий Песков Дмитрий Рогозин Дональд Трамп Евгения Васильева Забайкальский край Интервью ученых Ирина Яровая Иркутская область История человечества Калужская область Кирилл Серебренников Кировская область Конституционный суд Космодром Байконур Краснодарский край Красноярский край Ксения Собчак Ленинградская область МИД России Мария Захарова Михаил Прохоров Михаил Саакашвили Михаил Ходорковский Московская область Мурманская область Надежда Савченко Наталья Поклонская Нижний Новгород Николас Мадуро Нобелевская премия Новосибирская область Новый год Олег Дерипаска Олимпийские игры Ольга Голодец Павел Дуров Палестинская автономия Папа Римский Первый канал Пермский край Петр Порошенко Почта России Приморский край Рамзан Кадыров Реджеп Эрдоган Республика Карелия Ростовская область Самарская область Саратовская область Саудовская Аравия Свердловская область Сергей Лавров Сергей Нарышкин Сергей Полонский Сергей Собянин Сергей Шойгу Следственный комитет Совбез ООН Совет Федерации Ставропольский край Счетная палата Тереза Мэй Тюменская область Франсуа Олланд Хабаровский край Хиллари Клинтон Человек дня Челябинская область Черное море Эдвард Сноуден Элла Памфилова Эльвира Набиуллина Эммануэль Макрон Южная Корея Юлия Тимошенко Юрий Чайка авторское право администрация президента акции протеста атомная энергия баллистические ракеты банковский сектор биология большой теннис визовый режим военная авиация выборы губернаторов газовая промышленность гражданская авиация гуманитарная помощь декларации чиновников домашние животные дороги России информационные технологии климат Земли компьютерная безопасность космодром Восточный крушение вертолета легкая атлетика лесные пожары междисциплинарные исследования мобильные приложения морской транспорт некоммерческие организации общественный транспорт патриарх Кирилл пенсионная реформа пищевая промышленность права человека правозащитное движение преступления полицейских публичные лекции российское гражданство русские националисты русский язык сельское хозяйство сотовая связь социальные сети стихийные бедствия телефонный терроризм уголовный кодекс фигурное катание финансовый рынок фондовая биржа химическое оружие хроники обнуления эволюция экономический кризис ядерное оружие Великая Отечественная война Всемирная организация здравоохранения Вторая мировая война Ирак после войны Ким Чен Ын Революция в Киргизии Российская академия наук Стихотворения на случай Федеральная миграционная служба Федеральная таможенная служба борьба с курением выборы мэра Москвы здравоохранение в России связь и телекоммуникации тюрьмы и колонии Совет по правам человека аварии на железной дороге естественные и точные науки закон об «иностранных агентах» компьютеры и программное обеспечение видеозаписи публичных лекций «Полит.ру» Новые технологии, инновации Сочи 2014 рейтинг Forbes Аль-Каида Кабардино-Балкария Левада-Центр Нью-Йорк Санкт-Петербург отставки-назначения шоу-бизнес Ростов-на-Дону ЧМ-2018 Книга. Знание ВИЧ/СПИД Путин20летназад новость20летназад Apple Bitcoin Boeing Facebook G20 Google iPhone IT Microsoft NATO PRO SCIENCE видео ProScience Театр Pussy Riot Telegram Twitter Wikileaks YouTube

Редакция

Электронная почта: polit@polit.ru
Телефон: +7 929 588 33 89
Яндекс.Метрика Top.Mail.Ru
Свидетельство о регистрации средства массовой информации
Эл. № 77-8425 от 1 декабря 2003 года. Выдано министерством
Российской Федерации по делам печати, телерадиовещания и
средств массовой информации. Выходит с 21 февраля 1998 года.
При любом использовании материалов веб-сайта ссылка на Полит.ру обязательна.
При перепечатке в Интернете обязательна гиперссылка polit.ru.
Все права защищены и охраняются законом.
© Полит.ру, 1998–2021.