22 октября 2020, четверг, 13:09
VK.comFacebookTwitterTelegramInstagramYouTubeЯндекс.ДзенОдноклассники

НОВОСТИ

СТАТЬИ

PRO SCIENCE

МЕДЛЕННОЕ ЧТЕНИЕ

ЛЕКЦИИ

АВТОРЫ

Исследователи предсказали возможные цели для эффективного иммунного ответа на новый коронавирус

SARS-CoV-2 (обозначен желтым) под сканирующим электронным микроскопом
SARS-CoV-2 (обозначен желтым) под сканирующим электронным микроскопом
NIAID Rocky Mountain Laboratories

Ученые из Института иммунологии в Ла-Холье, Института Крейга Вентера и Калифорнийского университета в Сан-Диего использовали имеющиеся данные об известных коронавирусах, чтобы предсказать, какие части SARS-CoV-2, нового коронавируса, вызывающего вирусную пневмонию COVID-19, способны активировать иммунную систему человека.

Ключевую роль в активизации иммунной системы организма при проникновении в него бактерий или вирусов играют так называемые эпитопы — небольшие части молекулы, которые распознаются иммунными клетками (В- и Т-лимфоцитами) и антителами. Наличие полной карты вирусных эпитопов и их иммуногенности имеет решающее значение для исследователей, пытающихся разработать вакцины для защиты от COVID-19. «В настоящее время у нас есть ограниченная информация о том, какие фрагменты вируса вызывают серьезную реакцию человека, — говорит ведущий автор исследования профессор Института иммунологии Алессандро Сетте (Alessandro Sette). — Знание иммуногенности определенных вирусных областей или, другими словами, на какие части вируса иммунная система реагирует и насколько сильно, имеет непосредственное отношение к разработке перспективных вакцин-кандидатов и их оценке».

Поскольку о реакции иммунной системы на новый вирус SARS-CoV-2 известно пока мало, ученые использовали богатые данные об эпитопах других коронавирусов. Среди людей давно циркулируют четыре коронавируса (229E, NL63, OC43 и HKU1). Они вызывают, как правило, нетяжелые заболевания и ответственны примерно за четверть сезонных ОРВИ. Но за последние годы трижды появлялись три коронавируса, вызывающие более тяжелые болезни: SARS-CoV в 2003 году и MERS-CoV в 2008 году, а теперь и SARS-CoV-2. «SARS-CoV-2 наиболее тесно связан с SARS-CoV, наиболее полно описанным коронавирусом с точки зрения эпитопов», — говорит первый автор исследования Альба Грифони (Alba Grifoni).

Ученые использовали информацию из базы данных иммунных эпитопов (IEDB), которая содержит более 600 000 известных эпитопов примерно 3600 различных видов, а также из Virus Pathogen Resource (ViPR), специализированного хранилища информации о патогенных вирусах. Они собрали известные эпитопы для SARS-CoV и нанесли на карту соответствующие области для SARS-CoV-2.

«Мы смогли сопоставить десять В-клеточных эпитопов с новым коронавирусом, и из-за общего высокого сходства последовательностей между SARS-CoV и SARS-CoV-2 существует высокая вероятность того, что те же самые области, которые являются иммунодоминантными в SARS-CoV, также доминируют в SARS-CoV-2», — говорит Альба Грифони. Пять из этих областей были обнаружены в гликопротеине, который образует «корону» на поверхности вируса, давшую коронавирусам их название. Два других расположены в белке, который встроен в мембрану, окружающую защитную белковую оболочку вокруг вирусного генома. Еще три находятся в нуклеопротеине, который образует белковую оболочку. Т-клеточные эпитопы в основном сконцентрированы в месте соединения гликопротеина и нуклеопротеина.

Ученые использовали также другой метод поиска эпитопов — алгоритм Tepitool для прогнозирования на основе пространственной структуры белковых молекул. Он был разработан на основе базы данных IEDB Джейсоном Маклелланом и его коллегами из Техасского университета. Чтобы подтвердить Т-клеточные эпитопы SARS-CoV-2, идентифицированные на основе их сходства с SARS-CoV, ученые сравнили их с эпитопами, определенными программой Tepitool в IEDB. В результате они подтвердили 12 из 17 предложенных эпитопов.

«Тот факт, что мы обнаружили, сохранение высокой степени сходства В- и Т-клеточных эпитопов между SARS-CoV и SARS-CoV-2, становится отличной отправной точкой для разработки вакцин, — сказал профессор Алессандро Сетте. — Вакцинные стратегии, которые специально нацелены на эти регионы, могут создать иммунитет, который не только перекрестно защищает от обоих видов, но и относительно устойчив к продолжающейся эволюции вируса».

Результаты исследования опубликованы в журнале Cell Host & Microbe.

Обсудите в соцсетях

«Ангара» Африка Византия Вселенная Гренландия ДНК Иерусалим КГИ Луна МГУ МФТИ Марс Монголия НАСА РБК РВК РГГУ РадиоАстрон Роскосмос Роспатент Росприроднадзор Русал СМИ Сингапур Солнце Титан Юпитер акустика антибиотики античность антропогенез археология архитектура астероиды астрофизика бактерии бедность библиотеки биоинформатика биомедицина биомеханика бионика биоразнообразие биотехнологии блогосфера вакцинация викинги вирусы воспитание вулканология гаджеты генетика география геология геофизика геохимия гравитация грибы дельфины демография демократия дети динозавры животные здоровье землетрясение змеи зоопарк зрение изобретения иммунология импорт инновации интернет инфекции ислам исламизм исследования история карикатура картография католицизм кельты кибернетика киты клад климатология клонирование комары комета кометы компаративистика космос культура культурология лазер лексика лженаука лингвистика льготы мамонты математика материаловедение медицина металлургия метеориты микробиология микроорганизмы мифология млекопитающие мозг моллюски музеи насекомые наука нацпроекты неандертальцы нейробиология неолит обезьяны общество онкология открытия палеоклиматология палеолит палеонтология память папирусы паразиты перевод питание планетология погода политика право приматы природа психиатрия психоанализ психология психофизиология птицы путешествие пчелы ракета растения религиоведение рептилии робототехника рыбы сердце смертность собаки сон социология спутники старение старообрядцы стартапы статистика такси технологии тигры топливо торнадо транспорт ураган урбанистика фармакология физика физиология фольклор химия христианство цифровизация школа экзопланеты экология электрохимия эпидемии эпидемиология этология язык Александр Беглов Алексей Ананьев Дмитрий Козак Древний Египет Западная Африка Латинская Америка НПО «Энергомаш» Нобелевская премия РКК «Энергия» Российская империя Сергиев Посад Солнечная система альтернативная энергетика аутизм биология бозон Хиггса вымирающие виды глобальное потепление грипп защита растений инвазивные виды информационные технологии искусственный интеллект история искусства история цивилизаций исчезающие языки квантовая физика квантовые технологии климатические изменения компьютерная безопасность компьютерные технологии космический мусор криминалистика культурная антропология культурные растения междисциплинарные исследования местное самоуправление мобильные приложения научный юмор облачные технологии обучение одаренные дети педагогика персональные данные подготовка космонавтов преподавание истории продолжительность жизни происхождение человека русский язык сланцевая революция физическая антропология финансовый рынок черные дыры эволюция эволюция звезд эмбриональное развитие этнические конфликты ядерная физика Вольное историческое общество Европейская южная обсерватория жизнь вне Земли естественные и точные науки НПО им.Лавочкина Центр им.Хруничева История человека. История институтов дело Baring Vostok Протон-М 3D Apple Big data Dragon Facebook Google GPS IBM MERS PayPal PRO SCIENCE видео ProScience Театр SpaceX Tesla Motors Wi-Fi

Редакция

Электронная почта: polit@polit.ru
Телефон: +7 929 588 33 89
Яндекс.Метрика Top.Mail.Ru
Свидетельство о регистрации средства массовой информации
Эл. № 77-8425 от 1 декабря 2003 года. Выдано министерством
Российской Федерации по делам печати, телерадиовещания и
средств массовой информации. Выходит с 21 февраля 1998 года.
При любом использовании материалов веб-сайта ссылка на Полит.ру обязательна.
При перепечатке в Интернете обязательна гиперссылка polit.ru.
Все права защищены и охраняются законом.
© Полит.ру, 1998–2020.